与管道、储罐等的外部阴极保护相比较，内部电化学保护受到某些的限制，以下详细列明各项限制。

①因为所用材料和介质的多样性，必须根据每一保护系统的具体条件以及每一个操作阶段的特定状态确定自然腐蚀电位与保护范围。

②电解质与要保护的构筑物的表面积之比明显低于外部电化学保护。因此，电流分布，特别是在无防腐层表面上的电流分布受到了限制。带有插入构件（搅拌器、加热器等）结构复杂的设备的内部电化学保护尤其困难，只能靠增加电极数量以及恰当安排多支保护电极才可能达到均匀的电流分布。